针对你的问题我的回复如下:
1. 针对多个单位(affiliation),并没有顺序的硬性规定,不过,一般来说会先写学术单位,因为大学是提供研究指导和支持的单位,所以我会建议先放大学,然后再放其他单位。
2. 这两种方式都对,但最好使用单位常用的名字,也就是单位网站上使用的名字。
3. 如果你的大学跟医院在同一个城市,你可以这么写:
Department of -----------, College of Medicine, Gyeong Sang National University; and Institute of Health Sciences, Jinju, South Korea.
关于多个单位更详细的表现方式可以参考这里。