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表达基因和基因产物的格式技巧

Yateendra Joshi | 2015年6月24日 | 7,109 浏览次数
表达基因和基因产物的格式技巧

有些格式风格简单直接,有些则需要理解相关主题,这里要讨论的基因和基因产物就是一例。「以斜字体表示品种的学名」﹑「以斜字体表示基因符号」都是很简单的指示,但基因命名不只如此,本文不探讨这些简单的部分,而是着重在复杂之处。

其中一个复杂点是不同的生物各有不同的风格格式标准,比如人类基因的命名是按照国际人类细胞学术语命名法,而大部分品种的化学式,第一个大写字母代表显性基因,之后的小写字母代表隐性基因。Hs 代表毛鞘,玉米的显性基因, 注意第一个字母是大写斜体 ;sh 是萎缩的胚乳,一个隐形症状,注意字母是小写,以上两个例子同时也反映出化学式的起始字母不一定代表特定的字词。

再回到生物群组间不同的使用习惯:酵母菌的基因符号都是由三个斜体字母组成,显性基因大写,隐性基因小写,所以 MAL 代表发酵麦芽糖(fermenting maltose)的基因,gal 代表发酵半乳糖(fermenting galactose)的基因,酵母菌属真菌类,但其他组的真菌基因则不适用这个惯用规则。

还有基因座 loci,locus 的复数,表示同个基因的不同位置或地方,等位基因 alleles 则是表示在特定的染色体处于相同位置的基因,但异变后在同一特征具有不同版本,基因座的化学式是基因符号加上标的斜体阿拉伯数字,等位基因的化学式则由上标的小写字母加符号。

基因符号一般是斜体的,其产物则以正常非斜体罗马字母表示:HD 代表(人类)基因的huntingtin基因(一种蛋白质)或亨延顿病基因,而 HD 代表亨延顿病。

到这里,基因和蛋白命名之复杂显而易见,不遵循单一简单的规则。

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